Scientific Library of Tomsk State University

   E-catalog        

Normal view MARC view

A metagenomic window into the 2-km-deep terrestrial subsurface aquifer revealed multiple pathways of organic matter decomposition (Record no. 449524)

000 -Маркер записи
Контрольное поле постоянной длины 02975nab a2200397 c 4500
001 - Контрольный номер
Контрольное поле vtls000651032
005 - Дата корректировки
Контрольное поле 20240119174821.0
007 - Кодируемые данные (физ. описан.)
Контрольное поле постоянной длины cr |
008 - Кодируемые данные
Контрольное поле постоянной длины 190322|2018 enk s a eng dd
024 7# - Прочие стандартные номера
Стандартный номер 10.1093/femsec/fiy152
Источник номера doi
035 ## - Системный контрольный номер
Системный контрольный номер to000651032
040 ## - Источник каталогиз.
Служба первич. каталог. RU-ToGU
Код языка каталог. rus
Служба, преобразующая запись RU-ToGU
245 12 - Заглавие
Заглавие A metagenomic window into the 2-km-deep terrestrial subsurface aquifer revealed multiple pathways of organic matter decomposition
Ответственность V. V. Kadnikov, A. V. Mardanov, A. V. Beletsky [et al.]
504 ## - Библиография
Библиография Библиогр.: с. 13-16
520 3# - Аннотация
Аннотация We have sequenced metagenome of the microbial community of a deep subsurface thermal aquifer in the Tomsk Region of the Western Siberia, Russia. Our goal was the recovery of near-complete genomes of the community members to enable accurate reconstruction of metabolism and ecological roles of the microbial majority, including previously unstudied lineages. The water, obtained via a 2.6 km deep borehole 1-R, was anoxic, with a slightly alkaline pH, and a temperature around 45°C. Microbial community, as revealed by 16S rRNA gene profiling over 2 years, mostly consisted of sulfate-reducing Firmicutes and Deltaproteobacteria, and uncultured lineages of the phyla Chlorofexi, Ignavibacteriae and Aminicenantes (OP8). 25 composite genomes with more than 90% completeness were recovered from metagenome and used for metabolic reconstruction. Members of uncultured lineages of Chlorofexi and Ignavibacteriae are likely involved in degradation of carbohydrates by fermentation, and are also capable of aerobic and anaerobic respiration. The Chlorofexi bacterium has the Wood-Ljungdahl pathway of CO2 fixation. The recently identified candidate phylum Riflebacteria accounted for 5%–10% of microbial community. Metabolic reconstruction of a member of Riflebacteria predicted that it is an anaerobe capable to grow on carbohydrates by fermentation or dissimilatory Fe(III) reduction.
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова микробные сообщества
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова глубокие водоносные горизонты
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова Томская область
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова Западная Сибирь
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова метагеномный анализ
655 #4 - Термин индексирования — жанр/форма
Жанр/форма статьи в журналах
9 (RLIN) 879358
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Mardanov, Andrey V.
9 (RLIN) 138492
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Beletsky, Alexey V.
9 (RLIN) 101749
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Banks, David
9 (RLIN) 226865
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Pimenov, Nikolay V.
9 (RLIN) 131937
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Frank, Yuliya A.
9 (RLIN) 105430
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Karnachuk, Olga V.
9 (RLIN) 93087
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Ravin, Nikolay V.
9 (RLIN) 94440
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Kadnikov, Vitaly V.
9 (RLIN) 138493
773 0# - Источник информации
Название источника FEMS microbiology ecology
Место и дата издания 2018
Прочая информация Vol. 94, № 10. P. 1-16
ISSN 0168-6496
852 4# - Местонахождение единицы хранения
Код организации-хранителя RU-ToGU
856 4# - Электронный адрес документа
URL <a href="http://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/vtls:000651032">http://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/vtls:000651032</a>
908 ## - Параметр входа данных
Параметр входа данных статья
999 ## - Системные контрольные номера (Koha)
biblionumber (Koha) 449524

No items available.