Scientific Library of Tomsk State University

   E-catalog        

Normal view MARC view

Идентификация маркеров аденокарциномы желудка на основе биоинформатического поиска и анализа генной экспрессии (Record no. 428190)

000 -Маркер записи
Контрольное поле постоянной длины 06251nab a2200457 c 4500
001 - Контрольный номер
Контрольное поле vtls000587156
005 - Дата корректировки
Контрольное поле 20231201132522.0
007 - Кодируемые данные (физ. описан.)
Контрольное поле постоянной длины cr |
008 - Кодируемые данные
Контрольное поле постоянной длины 171020|2017 ru s c rus d
024 7# - Прочие стандартные номера
Стандартный номер 10.17650/2313-805X-2017-4-1-40-45
Источник номера doi
035 ## - Системный контрольный номер
Системный контрольный номер to000587156
040 ## - Источник каталогиз.
Служба первич. каталог. RU-ToGU
Код языка каталог. rus
Служба, преобразующая запись RU-ToGU
245 10 - Заглавие
Заглавие Идентификация маркеров аденокарциномы желудка на основе биоинформатического поиска и анализа генной экспрессии
Ответственность В. В. Волкоморов, Е. С. Григорьева, Г. В. Краснов [и др.]
246 11 - Заглавие тома/части
Заглавие тома/части Identification of the intestinal type gastric adenocarcinoma transcriptomic markers using bioinformatic and gene expression analysis
504 ## - Библиография
Библиография Библиогр.: 20 назв.
520 3# - Аннотация
Аннотация Введение. Одна из важных задач современной онкологии – поиск ассоциированных с опухолями молекулярных маркеров, которые могут использоваться для диагностики и прогнозирования рака, оценки степени радикальности операции и последующего лечения, а также раннего выявления рецидивов. Одним из продуктивных вариантов подобного поиска является анализ транскриптомных баз данных с применением методов биоинформатики с последующей валидацией полученных результатов на клиническом материале.Цель исследования – поиск мембранных белков, которые могут быть использованы для сывороточной диагностики аденокарциномы желудка интестинального гистологического типа.Материалы и методы. Идентификацию потенциальных маркеров рака желудка (РЖ) проводили с использованием баз данных Gene Ontology и the Cancer Genome Atlas (TCGA). Последующую оценку дифференциальной экспрессии генов выполняли на парных образцах аденокарциномы и нормальной ткани желудка, взятых от 55 пациентов. Экспрессию генов оценивали с помощью полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией в режиме реального времени по методу ΔCq.Результаты. Сравнительный анализ уровней синтеза матричных РНК (мРНК) нормальных и опухолевых тканей с применением нового алгоритма биоинформатического поиска привел к идентификации 3 наиболее высококопийных транскриптов (SULF1, PMEPA1 и SPARC), внутриклеточное содержание которых заметно повышается при РЖ. При анализе уровня мРНК данных генов в клиническом материале наблюдалось более чем двукратное увеличение уровня экспрессии PMEPA1 и SPARC в 75 % образцов РЖ интестинального гистологического типа. В образцах РЖ диффузного гистологического типа этот показатель составил 25 и 38 % соответственно.Выводы. Использование оригинального биоинформатического подхода, основанного на анализе данных TCGA, позволило выявить 2 гена (PMEPA1 и SPARC), преимущественно экспрессирующихся в опухолях желудка интестинального типа. Полученные результаты свидетельствуют об актуальности дальнейшего исследования роли этих генов в патогенезе РЖ и оценки клинической значимости уровня их экспрессии в опухолевой ткани.
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова аденокарцинома желудка
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова гистология человека
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова гены маркерные
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова генетическая база данных
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова экспрессия генов
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова PMEPA1, белок
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова SPARC, ген
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова полимеразные цепные реакции
655 #4 - Термин индексирования — жанр/форма
Жанр/форма статьи в журналах
9 (RLIN) 879358
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Григорьева, Евгения Сергеевна
9 (RLIN) 90590
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Краснов, Георгий Сергеевич
9 (RLIN) 478479
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Литвяков, Николай Васильевич
9 (RLIN) 80341
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Лисицын, Николай Александрович
9 (RLIN) 478480
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Воевода, Михаил Иванович
9 (RLIN) 267165
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Белковец, Анна Владимировна
9 (RLIN) 478481
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Афанасьев, Сергей Геннадьевич
9 (RLIN) 410355
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Чердынцева, Надежда Викторовна
9 (RLIN) 76362
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Волкоморов, Виктор Владимирович
9 (RLIN) 90589
773 0# - Источник информации
Название источника Успехи молекулярной онкологии
Место и дата издания 2017
Прочая информация Т. 4, № 1. С. 40-45
ISSN 2313-805X
852 4# - Местонахождение единицы хранения
Код организации-хранителя RU-ToGU
856 7# - Электронный адрес документа
URL <a href="http://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/vtls:000587156">http://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/vtls:000587156</a>
908 ## - Параметр входа данных
Параметр входа данных статья
999 ## - Системные контрольные номера (Koha)
biblionumber (Koha) 428190

No items available.