Normal view
MARC view
DNA extraction protocols may influence biodiversity detected in the intestinal microbiome: a case study from wild Prussian carp, Carassius gibelio (Record no. 419750)
[ view plain ]
| 000 -Маркер записи | |
|---|---|
| Контрольное поле постоянной длины | 02507naa a2200373 c 4500 |
| 001 - Контрольный номер | |
| Контрольное поле | vtls000577220 |
| 005 - Дата корректировки | |
| Контрольное поле | 20230319210658.0 |
| 007 - Кодируемые данные (физ. описан.) | |
| Контрольное поле постоянной длины | cr | |
| 008 - Кодируемые данные | |
| Контрольное поле постоянной длины | 170608s2017 ru s engsdd |
| 024 7# - Прочие стандартные номера | |
| Стандартный номер | 10.1093/femsec/fiw240 |
| Источник номера | doi |
| 035 ## - Системный контрольный номер | |
| Системный контрольный номер | to000577220 |
| 040 ## - Источник каталогиз. | |
| Служба первич. каталог. | RU-ToGU |
| Код языка каталог. | rus |
| Служба, преобразующая запись | RU-ToGU |
| 100 1# - Автор | |
| Автор | Kashinskaya, Elena N. |
| 9 (RLIN) | 473159 |
| 245 10 - Заглавие | |
| Заглавие | DNA extraction protocols may influence biodiversity detected in the intestinal microbiome: a case study from wild Prussian carp, Carassius gibelio |
| Ответственность | E. N. Kashinskaya, K. B. Andree, E. P. Simonov и др. |
| 504 ## - Библиография | |
| Библиография | Библиогр.: с. 12-14 |
| 520 3# - Аннотация | |
| Аннотация | In this investigation, we examined the influence of different DNA extraction protocols on results obtained for intestinal microbiota of Prussian carp. We showed that significant differences were observed in numbers of reads, OTUs, Shannon index and taxonomic composition between two different DNA extraction protocols for intestine of Prussian carp (Carassius gibelio), and differences were also evident between microbial communities in the intestinal mucosa and intestinal content. Statistical analyses of 25 published articles also revealed a significant relationship between methods of DNA extraction and bacterial diversity in fish intestine of freshwater species. Microbial diversity, community structure, proportions of read numbers derived from each OTU and the total number of OTU's obtained by different DNA extraction protocols could lead to a bias in results obtained in some cases, and therefore researchers should be conservative in conclusions about community structures. |
| 653 ## - Ключевые слова | |
| Ключевые слова | генетическое разнообразие |
| 653 ## - Ключевые слова | |
| Ключевые слова | микробиота |
| 653 ## - Ключевые слова | |
| Ключевые слова | кишечник |
| 653 ## - Ключевые слова | |
| Ключевые слова | рыбы |
| 653 ## - Ключевые слова | |
| Ключевые слова | метагеномное секвенирование |
| 653 ## - Ключевые слова | |
| Ключевые слова | экстракция ДНК |
| 653 ## - Ключевые слова | |
| Ключевые слова | серебряный карась |
| 655 #4 - Термин индексирования — жанр/форма | |
| Жанр/форма | статьи в журналах |
| 9 (RLIN) | 879358 |
| 700 1# - Другие авторы | |
| Другие авторы | Andree, Karl B. |
| 9 (RLIN) | 473160 |
| 700 1# - Другие авторы | |
| Другие авторы | Simonov, Evgeniy P. |
| 9 (RLIN) | 102899 |
| 700 1# - Другие авторы | |
| Другие авторы | Solovyev, Mikhail M. |
| 9 (RLIN) | 473161 |
| 773 0# - Источник информации | |
| Название источника | FEMS microbiology ecology |
| Место и дата издания | 2017 |
| Прочая информация | Т. Vol. 93, № 2. P. 1-14 |
| ISSN | 0168-6496 |
| 852 4# - Местонахождение единицы хранения | |
| Код организации-хранителя | RU-ToGU |
| 856 7# - Электронный адрес документа | |
| URL | <a href="http://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/vtls:000577220">http://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/vtls:000577220</a> |
| 908 ## - Параметр входа данных | |
| Параметр входа данных | статья |
| 999 ## - Системные контрольные номера (Koha) | |
| biblionumber (Koha) | 419750 |
No items available.