Scientific Library of Tomsk State University

   E-catalog        

Normal view MARC view

Epigenetic differences in monozygotic twins discordant for major depressive disorder (Record no. 252562)

000 -Маркер записи
Контрольное поле постоянной длины 03549nab a2200349 c 4500
001 - Контрольный номер
Контрольное поле vtls000626402
005 - Дата корректировки
Контрольное поле 20230319180555.0
007 - Кодируемые данные (физ. описан.)
Контрольное поле постоянной длины cr |
008 - Кодируемые данные
Контрольное поле постоянной длины 180508|2016 enk s a eng d
024 7# - Прочие стандартные номера
Стандартный номер 10.1038/tp.2016.101
Источник номера doi
035 ## - Системный контрольный номер
Системный контрольный номер to000626402
040 ## - Источник каталогиз.
Служба первич. каталог. RU-ToGU
Код языка каталог. rus
Служба, преобразующая запись RU-ToGU
245 10 - Заглавие
Заглавие Epigenetic differences in monozygotic twins discordant for major depressive disorder
Ответственность K. Malki, E. Koritskaya, F. Harris [et.al.]
504 ## - Библиография
Библиография Библиогр.: 50 назв.
520 3# - Аннотация
Аннотация Although monozygotic (MZ) twins share the majority of their genetic makeup, they can be phenotypically discordant on several traits and diseases. DNA methylation is an epigenetic mechanism that can be influenced by genetic, environmental and stochastic events and may have an important impact on individual variability. In this study we explored epigenetic differences in peripheral blood samples in three MZ twin studies on major depressive disorder (MDD). Epigenetic data for twin pairs were collected as part of a previous study using 8.1-K-CpG microarrays tagging DNA modification in white blood cells from MZ twins discordant for MDD. Data originated from three geographical regions: UK, Australia and the Netherlands. Ninety-seven MZ pairs (194 individuals) discordant for MDD were included. Different methods to address non independently-and-identically distributed (non-i.i.d.) data were evaluated. Machine-learning methods with feature selection centered on support vector machine and random forest were used to build a classifier to predict cases and controls based on epivariations. The most informative variants were mapped to genes and carried forward for network analysis. A mixture approach using principal component analysis (PCA) and Bayes methods allowed to combine the three studies and to leverage the increased predictive power provided by the larger sample. A machine-learning algorithm with feature reduction classified affected from non-affected twins above chance levels in an independent training-testing design. Network analysis revealed gene networks centered on the PPAR-γ (NR1C3) and C-MYC gene hubs interacting through the AP-1 (c-Jun) transcription factor. PPAR-γ (NR1C3) is a drug target for pioglitazone, which has been shown to reduce depression symptoms in patients with MDD. Using a data-driven approach we were able to overcome challenges of non-i.i.d. data when combining epigenetic studies from MZ twins discordant for MDD. Individually, the studies yielded negative results but when combined classification of the disease state from blood epigenome alone was possible. Network analysis revealed genes and gene networks that support the inflammation hypothesis of MDD.
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова депрессивные расстройства
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова эпигенетические различия
653 ## - Ключевые слова
Ключевые слова монозиготные близнецы
655 #4 - Термин индексирования — жанр/форма
Жанр/форма статьи в журналах
9 (RLIN) 879358
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Malki, Karim
9 (RLIN) 340914
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Harris, F.
9 (RLIN) 340915
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Bryson, K.
9 (RLIN) 340916
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Herbster, M.
9 (RLIN) 340917
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Tosto, Maria Grazia
9 (RLIN) 297057
700 1# - Другие авторы
Другие авторы Koritskaya, E.
9 (RLIN) 340918
773 0# - Источник информации
Название источника Translational psychiatry
Место и дата издания 2016
Прочая информация Vol. 6. P. e839 (1-10)
ISSN 2158-3188
852 4# - Местонахождение единицы хранения
Код организации-хранителя RU-ToGU
856 7# - Электронный адрес документа
URL <a href="http://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/vtls:000626402">http://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/vtls:000626402</a>
908 ## - Параметр входа данных
Параметр входа данных статья
999 ## - Системные контрольные номера (Koha)
biblionumber (Koha) 252562

No items available.